Berdasarkan SK-SK yang ada secara urut dijelaskan bahwa berdirinya SMP Ya BAKII 1 Kesugihan kabupaten Cilacap adalah sebagai berikut :

1. SMP Ya BAKII 1 Kesugihan Kabupaten Cilacap berdiri pada tanggal 01 Januari 1968 dengan nama SMP BAKTI yang pengajuannya pada tanggal 09 Januari 1968 ditandatangani oleh Chasbullah Badawi, BA sebagai Kepala Sekolah yang kemudian mendapatkan surat tanda tercatat dari Perwakilan Dep. P dan K Propinsi Jawa Tengah, Kantor Pembinaan SMP sebagai SMP swasta nomor 45 / BMS / B / 1970 dengan nama SMP Bhakti yang ditanda tangani oleh a.n. Kepala kantor Pembinaan SMP, R. Maliat Kustur.

2. Selanjutnya SMP BAKTI berubah menjadi SMP Ya Bakti dengan dasar dari surat dari Perwakilan Dep. P dan K Propinsi Jawa Tengah, Kantor Pembinaan SMP dengan nomor 19 / III / B / 1972.

3. Selanjutnya SMP Ya Bakti berubah menjadi Sekolah Menengah Pertama Yayasan Badan Amal Kesejahteraan Ittihadul Islamiyyah Kesugihan disingkat SMP Ya BAKII Kesugihan yang beralamat Jalan Salakan Sebelah lapangan Kesugihan di kesugihan, ditetapkan pada tanggal 30 Januari 1972 berdasarkan SK Yayasan BAKII dengan Nomor Surat: 09/yabakii/A.1271/I 72, ditandatangani oleh AchmadThoha selaku ketua II Ya BAKII, sedangkan Yayasan BAKII itu sendiri berdiri dengan Akta Notaris No. 6 tanggal 11 Desember 1971.

4. Nama SMP Ya BAKII Kemudian diperkuat secara yuridis oleh Surat Keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Republik Indonesia tertanggal 9 Januari 1981 dengan nomor surat 2671 / D / 1 / 81 yang berisi menetapkan bahwa SMP Ya BAKII di Kesugihan , Cilacap yang diselenggarakan oleh Pengurus Yayasan Badan Amal Kesejahteraan Ittihadul Islamiyah diKesugihan, Cilacap terhitung Tanggal 1 Juli 1980 sebagai Sekolah Swasta.

5. SMP Ya BAKII 1 Kesugihan mendapatkan status akreditasi DIAKUI pada tahun 1985 berdasarkan surat dari Departemen Pendidikan dan Kebudayaan Kantor Wilayah Propinsi Jawa Tengah dengan nomor 679/I 03.8.4/U.85 tentang Pengumuman Hasil Akreditasi SMP Tahap I tertanggal 14 Oktober 1985 dan berdasarkan surat edaran Direktur Jendral Pendidikan Dasar dan Menengah nomor : 1138/c/I.85 Tanggal 22 Januari 1985 dengan tanda tangan Kepala Kantor Wilayah, Kepala Bidang Dikmenum Drs. Magfuri, NIP. 1302118438.

6. SMP Ya BAKII 1 Kesugihan mendapatkan status akreditasi DISAMAKAN pada TANGGAL 14 Nopember 1991 berdasarkan piagam dari Departemen Pendidikan dan Kebudayaan Direktorat Jendral Pendidikan Dasar dan Menengah dengan nomor 380/I 03/H.91,An. Direktur Jendral Pendidikan Dasar dan Menengah, Direktur Sekolah Swasta, Drs. Sardjono sigit, NIP 130128218.

7. Pada Tahun 1998 SMP Ya BAKII 1 Kesugihan di akreditasi ulang mendapatkan nilai jenjang akreditasi DISAMAKAN berdasarkan Piagam dari Departemen Pendidikan dan Kebudayaan Direktorat Jendral Pendidikan Dasar dan Menengah dengan nomor 380/I 03/H.91,An. Direktur Jendral Pendidikan Dasar dan Menengah, Direktur Sekolah Swasta, Drs. Umaedi, M.Ed, NIP 130349103

8. Pada Tahun 2003 SMP Ya BAKII 1 Kesugihan di akreditasi ulang mendapatkan nilai jenjang akreditasi B ( Baik ) berdasarkan Surat Keputusan dari Kepala Dinas Departemen Pendidikan dan Kebudayaan Kabupaten Cilacap Nomor : 421 / 0532 / 03 / 30,yang ditetapkan di Cilacap pada tanggal 2 Maret 2004 oleh Drs. Sutoyo MS, M. Ed. Pembina Tk. I NIP 130901446.

9. Nomor Identitas Sekolah ( NIS ) SMP YA BAKII 1 Kesugihan 200290 berdasarkan Sertifikat Nomor : 420 / 4290 / 01 / 30,yang ditetapkan di Cilacap, 15 Nopember 2003 oleh Kepala Dinas Departemen Pendidikan dan Kebudayaan Kabupaten Cilacap, Drs. Sutoyo MS, M. Ed. Pembina Tk. I NIP 130901446.